Менотті швидко закінчив кар'єру футболіста, більшу частину якої провів на батьківщині. Втім довго не залишився без футболу і вирішив стати тренером.
Після успіху на клубному рівні йому доручили посаду головного тренера збірної Аргентини. Попри шалені проблеми зі складом і складною політичною ситуацією Сесар Луїс Менотті став першим в історії тренером, з яким Аргентина виграла чемпіонат світу. Сталось це на домашньому Мундіалі у 1978 році. Щоправда, після такого успіху наставник довго не застримався у збірній і незабаром очолив каталонську Барселону.
З "блаугранас" швидко виграв три трофеї, серед яких Кубок і Суперкубок Іспанії та Кубок ліги, й покинув клуб. Пізніше працював у Атлетіко, низці аргентинських клубів, збірній Мексики тощо.
